Como diria Jack... vamos por partes...
1° teoricamente Nao averia problemas em se usar um carregador de pouca potencia, a unica diferença é que demoraria uma vida para carregar por completo.
2° Fato que ja aconteceu comigo: um carregador daqueles turnigy super simples (creio que seja o mesmo seu)
http://www.hobbyking.com/hobbyking/store/__7637__Turnigy_balancer_Charger_2S_3S.htmlele "errava" ao balancear as celulas, aparentemente boa parte dos carregadores fazem o balanceamento descarregando as celulas apos uma carga em que se obtenha a voltagem nominal da bateria, no caso desse ele parecia estar tentando balancear sem dar carga alguma, entao como a bateria ja estava com pouca carga ela acabava ficando abaixo do limite entao ele indicava erro.
isso aconteceu com cerca de 3 baterias, tendo inclusive danificado uma, que agora nao tem nem metade da carga nominal...
existe sim como fazer a lipo voltar a ser aceita pelos carregadores (ao menos na maioria dos casos), mas é realmente muito perigoso, entao nao se recomenda, (caso queira correr o risco me envie MP por razoes de segurançao nao vou explicar no topico...)
Recomendo que voçe troque de carregador o quanto antes deixando este so pra emergencias...